Haigus esineb kuni 5. eluaastani, kuid peamiselt 2.-3. eluaastal. Samas, kui see esineb enne 2. või pärast 5. eluaastat, on selle sümptomid raskemad. Kawasaki sündroom algab veresoonte (vaskuliit) kaasamisega esimese 10 päeva jooksul.
Kawasaki sündroom jaguneb ajaliselt kolmeks faasiks:
- akuutne staadium kahe nädala jooksul
- subakuutne staadium 2-4 nädalat
- taastumisfaas 1-3 kuud
Kahjustus toimub peamiselt südameveresoonte ja nende seina tasandil. Selle tulemuseks on trombotsüütide kokkukleepumine. Tekib verehüübe (tromb). See aheneb hiljem, et sulgeda veresoon täielikult. Südamelihase ebapiisav verevarustus kuni täieliku veretustumiseni (isheemia) on südamelihase infarkti põhjused. Ajavahemikuks on antud kuni 8 nädalat.
Lisaks müokardiinfarktile on veresoone funktsiooni kahjustamisega seotud ka veresoonte seina kahjustus. Selle tulemuseks on veresoonte seina väljavenitus (aneurüsm). Aneurüsmide puhul suureneb veresoonte seina rebenemise oht. See võib põhjustada kuni äkksurma, mis esineb umbes 2% juhtudest.
Ägedas faasis esineb palavik, isegi üle 40 °C. See püsib rohkem kui 5 päeva. Esineb mitte-kihtne konjunktiviit. Tüüpiliste sümptomitena on teatatud ka sõrmede ja varvaste turse. Turse on jäik.
Ägedale staadiumile järgneb nahapõletik lööbe või urtikaaria näol. Peamised piirkonnad on rindkere, kõht, mähkmete all olev osa ja suguelundite piirkond. Huuled on kuivad, pragunenud, punased.
Samuti keel, mis on vaarikakeele välimusega (mõnikord nimetatakse seda ka maasikakeeleks).
Selles staadiumis on haigusele iseloomulik ka emakakaela sõlme suurenemine, kuni 70%-l haigestunutest. Sõlme suurus võib olla üle 1,5 sentimeetri. Multisüsteemse kaasusega kaasneb ka maksa ja sapipõie kahjustus, mille tulemuseks on kõhuvalu, oksendamine ja kõhulahtisus. Esineb ka liigeste valu ja turse, mis on artriidi tagajärg.
Kahe nädala pärast läheb haigus üle subakuutsesse faasi. Subakuutses faasis esineb naha koorumist, eriti sõrmede ja küünevoodite piirkonnas. Kui ravi jäetakse tähelepanuta, suureneb aneurüsmi oht. Trombotsüütide arv tõuseb. Taastumisfaasi iseloomustab põletikuväärtuste langus.
Õnneks saavutatakse enamikul juhtudel paranemine. Oluline on varajane diagnoosimine ja ravi. Tüsistuste risk suureneb, kui seda ei ravita, kuid väikesel protsendil juhtudest ka ravi korral.